上官婉儿又向韦皇后推荐了姘头武三思，將武三思领进宫中。

李显於是开始与武三思商议政事，张柬之等人受到了武三思的遏制。

不久，武三思依靠韦皇后和安乐公主等人的支持，相继设计贬杀了张柬之、桓彦范、敬暉、袁恕己和崔玄暐等五王，权倾人主，不可一世。

上官婉儿又与其私通，並在所草詔令中，经常推崇武氏而排抑皇家，致使太子李重俊气愤不已。

景龙元年，公元707年七月，李重俊终於爆发，与左羽林大將军李多祚等，矫詔发羽林军三百余人，杀武三思、武崇训於其府第，並诛其亲党十余人，又引兵从肃章门斩关而入，叩击阁门而搜捕上官婉儿。

上官婉儿急忙逃至唐中宗和韦皇后处，並扬言说：“观太子之意，是先杀上官婉儿，然后再依次捕弒皇后和陛下。”

李显和韦皇后一时大怒，遂带著上官婉儿和安乐公主登上玄武门躲避兵锋，令右羽林將军刘仁景率飞骑二千余人，屯太极殿前，闭门自守。

李重俊因此兵败被杀。

上官婉儿由此更是深得李显、韦皇后信任，专秉內政，她祖父一案也被平反，上官仪追赠中书令、秦州都督、楚国公，上官庭芝追赠黄门侍郎、岐州刺史、天水郡公。

此后，上官婉儿又经常劝说李显，大量设置昭文馆学士，广召当朝词学之臣，多次赐宴游乐，赋诗唱和。每次都同时代替李显和韦皇后和安乐公主，数首並作，诗句优美，时人大多传诵唱和。对大臣所作之诗，李显又令她进行评定，名列第一者，常赏赐金爵，贵重无比。

因此，朝廷內外，吟诗作赋，靡然成风。

最⊥新⊥小⊥说⊥在⊥⊥⊥首⊥发！

上官婉儿酷爱藏书，曾藏书万余卷，所藏之书均以香薰之。百年之后，其书流落民间，依然芳香扑鼻且无虫蛀。

其母郑氏去世后追諡为节义夫人，婉儿上表將自己的品级降为婕妤以示哀悼，不久之后恢復。

李显派人又在上官婉儿居地穿池筑岩，穷极雕饰，常引大臣宴乐其中。当时，宫禁宽疏，允许宫內官员任意出入。

上官婉儿遂与一些宫官在宫外购筑宅第，经常与他们交接往来，有的人因此而求得高官要职。

中书侍郎崔湜就是因为与上官婉儿在外宅私通，后被引以为相的。不久，崔湜又在主持銓选时，多有违失，被御史李尚隱弹劾，以罪被贬外州司马；也因上官婉儿和安乐公主为其申理，仍官復原职。

景龙四年，公元710年，太平公主势力日盛，上官婉儿又依附上太平公主。

六月，李显突然驾崩，韦皇后將台阁政职、內外兵马大权以及中央禁军等全部安排了自己的党羽和族人，朝政大权尽落韦氏之手。

上官婉儿与太平公主起草了一份遗詔，打算立李重茂为皇太子，李旦辅政，韦皇后为皇太后摄政，以平衡各方势力，然而宰相宗楚客、韦温更改詔书，劝韦后效仿武则天。

得到消息的临淄王李隆基与太平公主商议，决定先下手为强，七月二十一日，李隆基发动唐隆之变，以禁军官兵攻入宫中，杀死韦后、安乐公主及所有韦后一党，拥立其父李旦登基。

上官婉儿执烛率宫人迎接，並把她与太平公主所擬遗詔拿给刘幽求观看，以证明自己是和李唐宗室站在一起的，刘幽求拿著遗詔求李隆基开恩，但李隆基不许，杀上官婉儿於旗下。

上官婉儿可谓死得极冤，太平公主非常哀伤，派人去弔祭，並出钱五百匹绢。

李隆基为什么坚持要杀死上官婉儿？这大概跟上官婉儿得势之后，从来没去结交李旦有关係。

不管结局如何，上官婉儿歷经武则天和李显两朝，掌管政权，也算是个奇女子，在公元2013年9月出土的上官婉儿的墓志铭上，记载上官婉儿曾四次向唐中宗进諫，反对立安乐公主为皇太女，从检举揭发，到辞官不做，再到削髮为尼，都没有得到唐中宗准许，最后以死相諫。她喝毒药后，太医紧急救治，才得以保命。

这一事可以看出来，上官婉儿还是很有諍臣的一面。

上官婉儿在《全唐诗》中存诗三十二首，其中《彩书怨》最出名：

叶下洞庭初，思君万里余。

露浓香被冷，月落锦屏虚。

欲奏江南曲，贪封蓟北书。

书中无別意，惟悵久离居。

诗中少女情怀，渴望被爱的情绪感人。

上官婉儿，不管她的官职做得多大，她的权势如何熏天，她，始终是那个充满诗情画意的少女······